茶树紫黄素脱环氧化酶基因的cDNA克隆及其生物信息学分析

2021-02-23 12:11:00热度:152°C

根据GenBank中已登录的植物紫黄素脱环氧化酶（VDE）基因序列，以其高度保守的氨基酸序列设计一对简并引物，采用RT-PCR与3′/5′-RACE相结合的方法，从茶树（Camellia sinensi)中克隆出VDE的全长cDNA，长度为1632bp，分析表明，该序列的5′-端和3′-端的非编码序列长度分别为61bp和140bp，开放阅读框为1422bp，编码473个氨基酸。其转运肽长度为132个氨基酸。成熟蛋白的氨基酸序列与拟南芥，莴苣，菠菜及烟草的同源性分别为83.5%。82.7%,82.1%和83.6%。且有3个特殊的结构域；半胱氨酸富集区，脂肪结合蛋白特征区和由谷氨酸富集的高电荷区，分析表明，茶树VDE具有热稳定性。

完成机构：安徽农业大学农业部茶叶生物技术重点开放实验室，安徽合肥230036

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